遺伝学:COVID-19の遺伝的リスク因子の解明
Nature
ヒトの重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)感染と新型コロナウイルス感染症(COVID-19)重症化の遺伝的基盤をマッピングする取り組みが世界規模で行われており、このほど感染感受性と重症化に関連する13か所のゲノム領域が新たに突き止められた。19か国で実施された46件の研究で対象となった合計約5万人のCOVID-19患者の分析が行われた結果を報告する論文が、今回Nature に掲載される。現在進行中の数々の研究により、SARS-CoV-2感染からCOVID-19発症に至る過程に関する新たな知見が期待されており、新薬開発や薬剤リパーパシングのための標的が特定される可能性もある。
男性、体重過多と高齢が、COVID-19患者の重症化に寄与する要因であることが明らかになっているが、これらのリスク因子では重症度の個人差を説明しきれない。一方、ウイルスの宿主であるヒトの遺伝的性質は、さまざまな感染症(呼吸器ウイルスを含む)の感染感受性と重症化に重要な役割を果たしていることが明らかになっている。SARS-CoV-2感染とCOVID-19においてヒトの遺伝的性質が果たす役割を探究するため、COVID-19 Host Genetics Initiative(COVID-19 HGI)が構築され、データを収集、共有、分析するための研究者の国際的ネットワークが形成された。
46件の研究で対象となったCOVID-19患者のゲノムワイド関連メタ解析の結果、SARS-CoV-2感染やCOVID-19重症化と関連する新規座位が特定された。これらの座位の中には、以前の研究で特定された自己免疫疾患、炎症性疾患や肺疾患形質と関連する座位と重複するものがあった一方、特定の亜集団にしか見られないものもあった。例えば、東アジア系の人々を対象とした4件の研究では、COVID-19重症化に関連する2つの座位が発見され、さまざまな祖先を有する人々を包括的に解析することの価値が浮き彫りになった。著者たちは、COVID-19 HGIという国際的な共同研究の枠組みができたことで、COVID-19に関連する宿主の遺伝的要因をかつてないスピードで新たに特定することができたと結論付けており、今後もデータ収集を継続して、祖先のサイズと多様性の両方の点で解析の規模を拡大していく予定である。
A global effort to map the genetic underpinnings of SARS-CoV-2 infection and COVID-19 disease severity in humans has identified 13 new genomic regions associated with susceptibility and severity. An analysis of almost 50,000 patients with COVID-19 from 46 studies across 19 countries is reported in Nature. The ongoing investigations may provide new insights into how infection causes disease and could identify targets for drug development or repurposing.
Being male and increasing weight and age have been shown to contribute to disease severity in patients with COVID-19, but these risk factors alone do not explain the variability in disease severity. Host genetics have been shown to have an important role in the susceptibility and severity of infectious diseases, including respiratory viruses. To explore the role of human genetics in SARS-CoV-2 infection and COVID-19, the COVID-19 Host Genetics Initiative (COVID-19 HGI) formed an international network of researchers to collect, share and analyse data.
Genome-wide association meta-analyses in patients with COVID-19 from these studies reveals novel loci that are associated with SARS-CoV-2 infection or COVID-19 severity. The authors find overlap between some of the loci identified here and those previously associated with autoimmune or inflammatory diseases, or lung disease traits. Some of the loci were only found in distinct subpopulations; for example, two loci associated with disease severity were discovered in four studies of individuals with East Asian ancestry, highlighting the value of globally comprehensive analyses of individuals from diverse ancestries. This international collaboration has enabled the identification of novel host genetic factors associated with COVID-19 with unprecedented speed, the authors conclude, and continues to collect data to expand the analysis both in terms of size and in terms of diversity of ancestries included.
doi: 10.1038/s41586-021-03767-x
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