遺伝学：ヒトの身長の遺伝的背景に関する新知見
Nature
ヒトの身長に関連する1万2000個以上の遺伝的バリアントが特定されたことを報告する論文が、Nature に今週掲載される。この知見は、これまでに報告されている中で最大規模のゲノムワイド関連解析（GWAS）である約540万人のゲノムワイド遺伝子型解析のデータによって得られた。
成人の身長は、遺伝性の形質であり、容易に測定できる。以前の研究で、主にヨーロッパ系の集団において、身長に関連する高頻度の遺伝的バリアント（骨格障害に関連する遺伝子を含む）が数多く同定された。身長は、観察可能なヒトの形質（表現型）の構造における遺伝的変異の役割を評価するためのモデル形質になっている。
今回、GIANTコンソーシアムのLoïc Yengoたちは、さまざまな人種の集団（約540万人）の遺伝的解析を行った。このサンプルの75.8％は、主な祖先がヨーロッパ系で、8.8％が東アジア系、8.5％がヒスパニック系、5.5％がアフリカ系、1.4％が南アジア系であった。そして、身長と有意に関連する1万2111個の遺伝的バリアントが同定された。Yengoたちは、これらのバリアントが、特にヨーロッパ系の集団において、身長に関連する高頻度バリアントのほぼ全てを網羅しているという見解を示している。次に、ゲノム全体において、これらのバリアントの位置を調べたところ、成長障害に関連することがすでに知られている遺伝子の付近に集合している可能性の高いことが判明した。Yengoたちは、今回の研究で同定された身長に関連する遺伝的バリアントは、ヨーロッパ系の集団における身長の個人差の40％を説明できるが、他の集団では10～20％程度にとどまることを指摘している。
今回の知見は、十分に大きなサンプルサイズを確保できれば、個人差に寄与するゲノム領域の飽和マップを作製できることを示している。今回の研究で、ヨーロッパ系の集団における身長に関連するゲノム領域の飽和マップが得られたが、Yengoたちは、非ヨーロッパ系の集団についても同じレベルの飽和を達成するにはさらなる研究が必要になると結論付けている。
More than 12,000 genetic variants associated with human height are uncovered in a paper published in Nature this week. The findings are made through the analysis of genome-wide genotyping data from nearly 5.4 million individuals — the largest known genome-wide association study (GWAS) reported to date.
Adult height is heritable and easily measurable: previous research has identified a large number of common genetic variants associated with height, including genes associated with skeletal disorders, primarily in populations with European ancestry. Height provides a model trait for assessing the role of genetic variation in the architecture of observable human traits (phenotypes).
Loïc Yengo and colleagues from the GIANT consortium performed genetic analyses of nearly 5.4 million individuals from a range of ancestries: 75.8% of the sample had predominantly European ancestry, 8.8% predominantly East Asian ancestry, 8.5% predominantly Hispanic ancestry, 5.5% predominantly African ancestry and 1.4% predominantly South Asian ancestry. They identified 12,111 independent genetic variants that are significantly associated with height. The authors suggest these variations account for nearly all common variants associated with height, particularly in populations of European ancestry. When they looked at the position of these variants across the genome they found variants were more likely to be clustered close to genes already known to be associated with growth disorders. The authors indicate that the genetic variants associated with height identified in this study account for 40% of the variation in height in populations with European ancestry, but only around 10–20% in other ancestries.
The findings demonstrate that, with sufficiently large sample sizes, we can produce a saturated map of regions in the genome that contribute to variation. They conclude that although their study provides a saturated map of the genomic regions associated with height in populations with European ancestry, further research is needed in groups of non-European ancestries to achieve the same level of saturation.
doi: 10.1038/s41586-022-05275-y
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