Volume 55 Number 1

一細胞の空間的モデリング

SPICEMIXは、内因的および空間的な因子を分析することにより細胞のアイデンティティーを決めることのできる計算ツールである。これにより、空間的な変数であるメタ遺伝子とより精密な細胞サブタイプの同定が可能となる。表紙の画像は、黒いスレート(石板)上の乾燥スパイスの混合物で、哺乳類の組織における不均一な細胞集団をなぞらえたものである。

参照論文:Article p. 78
画像制作:Science Photo Library/ Science Photo Library/Getty
表紙デザイン:Tulsi Voralia

目次

注目のハイライト

その他のハイライト

News & Views

エピゲノミクス:5-ヒドロキシメチルシトシンは遺伝子の転写領域内における異常な転写開始を防ぐことによって転写を安定化する

5-hydroxymethylcytosine stabilizes transcription by preventing aberrant initiation in gene bodies p.2

doi: 10.1038/s41588-022-01253-2

糖尿病:膵β細胞でのCRISPRスクリーニングによって2型糖尿病リスク遺伝子を検出

Identifying type 2 diabetes risk genes by β-cell CRISPR screening p.4

doi: 10.1038/s41588-022-01269-8

遺伝的多様性:CRISPRを用いた治療用ゲノム編集の設計において考慮すべき多様性

Accounting for diversity in the design of CRISPR-based therapeutic genome editing p.6

doi: 10.1038/s41588-022-01272-z

Research Briefings

食餌は寿命に及ぼす遺伝的効果を調節する

Diet modulates genetic effects on longevity p.8

doi: 10.1038/s41588-022-01247-0

空間アトラスから肺免疫についての知見が得られる

Spatial atlas reveals insight into lung immunity p.10

doi: 10.1038/s41588-022-01244-3

DNAメチル化から複雑形質の基盤となる分子的な結び付きが示される

DNA methylation provides molecular links underlying complex traits p.12

doi: 10.1038/s41588-022-01249-y

Letter

ゲノム医療:小さな凍結臨床試料のマルチモーダルな一細胞全ゲノム塩基配列決定

Multimodal single-cell and whole-genome sequencing of small, frozen clinical specimens p.19

doi: 10.1038/s41588-022-01268-9

Articles

COVID-19:SARS-CoV-2の診断検査率がゲノムサーベイランスプログラムの感度を決定する

SARS-CoV-2 diagnostic testing rates determine the sensitivity of genomic surveillance programs p.26

doi: 10.1038/s41588-022-01267-w

遺伝子編集:ヒトの遺伝学的多様性は治療用遺伝子編集のオフターゲット効果を変更する

Human genetic diversity alters off-target outcomes of therapeutic gene editing p.34

doi: 10.1038/s41588-022-01257-y

メタボロミクス:血漿メタボロームのゲノムアトラスによってヒト疾患に関与する代謝物を優先順位付けする

Genomic atlas of the plasma metabolome prioritizes metabolites implicated in human diseases p.44

doi: 10.1038/s41588-022-01270-1

糖尿病:ゲノム規模のCRISPRスクリーニングにより、2型糖尿病リスクに影響する膵β細胞機能制御因子としてCALCOCO2を同定

A genome-wide CRISPR screen identifies CALCOCO2 as a regulator of beta cell function influencing type 2 diabetes risk p.54

doi: 10.1038/s41588-022-01261-2

呼吸器疾患:ヒト肺の空間分解されたアトラスから腺関連免疫ニッチの特徴が明らかになる

A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche p.66

doi: 10.1038/s41588-022-01243-4

空間トランスクリプトミクス:SpiceMixは細胞アイデンティティーの統合的な一細胞空間モデリングを可能にする

SpiceMix enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity p.78

doi: 10.1038/s41588-022-01256-z

がん:ヨーロッパ系および東アジア系の症例10万204人と対照15万4587人についてのマルチオミクス解析による大腸がんの遺伝学的性質の解読

Deciphering colorectal cancer genetics through multi-omic analysis of 100,204 cases and 154,587 controls of European and east Asian ancestries p.89

doi: 10.1038/s41588-022-01222-9

転写/免疫:自然免疫応答を引き起こす誤った転写を5-ヒドロキシメチルシトシンが防止する

Spurious transcription causing innate immune responses is prevented by 5-hydroxymethylcytosine p.100

doi: 10.1038/s41588-022-01252-3

DNAメチル化:多様なヒト組織のDNAメチル化QTLマッピングによる遺伝的多様性と複雑形質の間の分子的関連の解明

DNA methylation QTL mapping across diverse human tissues provides molecular links between genetic variation and complex traits p.112

doi: 10.1038/s41588-022-01248-z

寿命:食餌ストレスが非近交系ショウジョウバエの寿命多様性の遺伝的構造を変化させる

Dietary stress remodels the genetic architecture of lifespan variation in outbred Drosophila p.123

doi: 10.1038/s41588-022-01246-1

DNAメチル化:マウスの胚発生と生殖細胞系列の発生におけるDNAヒドロキシメチル化とメチル化の動態

Dynamics of DNA hydroxymethylation and methylation during mouse embryonic and germline development p.130

doi: 10.1038/s41588-022-01258-x

トウモロコシ:トウモロコシにおけるマルチオミクス統合ネットワークマップ

A multi-omics integrative network map of maize p.144

doi: 10.1038/s41588-022-01262-1

Technical Report

メタ解析:大規模な全ゲノム塩基配列決定解析における希少なバリアントとの関連についての検出力が高くスケーラブルで資源効率の高いメタ解析手法

Powerful, scalable and resource-efficient meta-analysis of rare variant associations in large whole genome sequencing studies p.154

doi: 10.1038/s41588-022-01225-6

「Journal home」へ戻る

プライバシーマーク制度