Volume 56 Number 3

ヤセイカンランのパンゲノム

ヤセイカンラン(キャベツなどの原種)の22アクセッションの新規ゲノムアセンブリとパンゲノム解析により、構造変異の遺伝子発現への影響および形態型の多様化への寄与が明らかになった。

参照論文:Li et al. Article p.517
写真撮影:Chang Keyong(中国、北京)
表紙デザイン:Tulsi Voralia
 

目次

注目のハイライト

その他のハイライト

News & Views

代謝疾患:妊娠糖尿病の遺伝学的性質についての新たな手掛かり

New insights into the genetics of diabetes in pregnancy p.358

doi: 10.1038/s41588-024-01675-0

クロマチン構成:クロマチンを一から構築する

Building chromatin from the ground up p.360

doi: 10.1038/s41588-024-01666-1

空間オミクス解析:空間オミクスの細胞近傍解析によって新たな組織ドメインと細胞サブタイプが明らかになる

Cellular neighborhood analysis in spatial omics reveals new tissue domains and cell subtypes p.362

doi: 10.1038/s41588-023-01646-x

変異シグネチャー:がんの変異過程の特定を向上させる

Improved identification of cancer mutational processes p.365

doi: 10.1038/s41588-024-01679-w

Research Briefings

全体的なクロマチン接近性を形作るタンパク質

Proteins shaping global chromatin accessibility p.367

doi: 10.1038/s41588-024-01667-0

構造変異が遺伝子発現を微調整して、ヤセイカンランの多様化を導く

Structural variations fine-tune gene expression to steer Brassica oleracea diversification p.369

doi: 10.1038/s41588-024-01656-3

Brief Communication

がん遺伝学:がんにおける複雑な遺伝子型と表現型の関連を探索するための複合的な遺伝学的戦略

A combinatorial genetic strategy for exploring complex genotype–phenotype associations in cancer p.371

doi: 10.1038/s41588-024-01674-1

Letter

糖尿病:妊娠糖尿病と2型糖尿病の遺伝学的構造における相違点と共通点

Distinct and shared genetic architectures of gestational diabetes mellitus and type 2 diabetes p.377

doi: 10.1038/s41588-023-01607-4

Articles

ハンチントン病:ヒトの線条体および小脳における細胞タイプ特異的なCAGリピート伸長と変異型ハンチンチンの毒性

Cell-type-specific CAG repeat expansions and toxicity of mutant Huntingtin in human striatum and cerebellum p.383

doi: 10.1038/s41588-024-01653-6

骨格筋ミオパチー:筋肉特異的なプロテインキナーゼと巨大タンパク質タイチンが関与する二遺伝子遺伝が骨格筋ミオパチーを引き起こす

Digenic inheritance involving a muscle-specific protein kinase and the giant titin protein causes a skeletal muscle myopathy p.395

doi: 10.1038/s41588-023-01651-0

インフルエンザ:エピジェネティックな多様性がインフルエンザ感染に対する転写応答の個人差に影響する

Epigenetic variation impacts individual differences in the transcriptional response to influenza infection p.408

doi: 10.1038/s41588-024-01668-z

先天性心疾患:先天性心疾患におけるヒト心臓のエンハンサーと非コードde novoバリアントの機能的解明

Functional dissection of human cardiac enhancers and noncoding de novo variants in congenital heart disease p.420

doi: 10.1038/s41588-024-01669-y

空間オミクス解析:BANKSYは細胞タイプの判定と組織ドメインの区分けを統合し、スケーラブルな空間オミクスデータ解析を行う

BANKSY unifies cell typing and tissue domain segmentation for scalable spatial omics data analysis p.431

doi: 10.1038/s41588-024-01664-3

腎細胞がん:淡明細胞型腎細胞がんのマルチオミクスプロファイリングで見つかった疾患プログレッションに関連する代謝再プログラム化

Multi-omic profiling of clear cell renal cell carcinoma identifies metabolic reprogramming associated with disease progression p.442

doi: 10.1038/s41588-024-01662-5

大腸がん:経路レベルのサブタイプ分類によって大腸がんの臨床転帰不良に関連する細胞周期の遅い生物学的表現型が特定される

Pathway level subtyping identifies a slow-cycling biological phenotype associated with poor clinical outcomes in colorectal cancer p.458

doi: 10.1038/s41588-024-01654-5

クロマチン解析:ゲノムワイドATAC-seeスクリーニングによりTFDP1は全体的なクロマチン接近性の調節因子であることが明らかになった

Genome-wide ATAC-see screening identifies TFDP1 as a modulator of global chromatin accessibility p.473

doi: 10.1038/s41588-024-01658-1

クロマチン構成:クロマチンドメインのin vitro再構成から明らかになった3Dゲノム構造におけるヌクレオソームの配置の役割

In vitro reconstitution of chromatin domains shows a role for nucleosome positioning in 3D genome organization p.483

doi: 10.1038/s41588-023-01649-8

クロマチン構造:Hox遺伝子群のポリコームによる抑制には空間的なフィードバックが関与するが、ドメイン凝縮や相移行は関与しない

Polycomb repression of Hox genes involves spatial feedback but not domain compaction or phase transition p.493

doi: 10.1038/s41588-024-01661-6

リンゴ:ハプロタイプを区別したギャップのほぼ存在しないリンゴゲノムにより、台木による果樹の矮化の遺伝的基盤が明らかになる

Near-gapless and haplotype-resolved apple genomes provide insights into the genetic basis of rootstock-induced dwarfing p.505

doi: 10.1038/s41588-024-01657-2

ヤセイカンラン:構造変異によって引き起こされる大規模な遺伝子発現の変化によってアブラナ科のヤセイカンランに形態型の多様化がもたらされる

Large-scale gene expression alterations introduced by structural variation drive morphotype diversification in Brassica oleracea p.517

doi: 10.1038/s41588-024-01655-4

ラッカセイ:新たなゲノム多様性マップにより中国におけるラッカセイの多様性と28の農業形質との関連性が明らかになる

A genomic variation map provides insights into peanut diversity in China and associations with 28 agronomic traits p.530

doi: 10.1038/s41588-024-01660-7

Technical Report

変異シグネチャー:MuSiCalを用いた正確かつ高感度の変異シグネチャー解析

Accurate and sensitive mutational signature analysis with MuSiCal p.541

doi: 10.1038/s41588-024-01659-0

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