がんゲノミクス：がんの活性なプロモーターでの変異率

がんにおける最近のゲノム全域の解析により、遺伝子プロモーター内に体細胞点変異の多数のホットスポットがあることが確認されている。今回、2つの論文でこの関係が調べられ、転写開始とDNA修復を結び付ける機構が存在する証拠が見つかった。J Wongたちは、14種に及ぶがんの1000以上のがんゲノムを解析し、遺伝子プロモーターでの変異密度の上昇が、転写開始活性およびヌクレオチド除去修復の阻害に結び付けられることを見いだした。プロモーターの変異密度は、がんの除去修復への依存と相関している可能性がある。N López-Bigasたちは、黒色腫のゲノムデータの解析を行い、プロモーター領域内の活性な転写因子結合部位で体細胞変異率が上昇していることを見いだした。このようなゲノム領域でのがんの変異率の上昇は、タンパク質が結合したDNAはヌクレオチド除去修復装置へ接近しにくくなるためだと説明できる。

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