ゲノミクス：マウスのエピゲノムのトランス作動性ネットワーク

以前、マウスの計25種類の細胞や組織に関して、ゲノムのDNアーゼIフットプリント解析データが作成された。今回、同じ研究グループがそのデータを用いて、哺乳類の遺伝子調節の進化に対するシス調節とトランス調節の関与を定量化した。計600個以上のモチーフが報告され、その95％以上がヒトの転写因子（TF）によってin vivoで認識される配列と似ていた。それぞれのTF遺伝子を取り巻くシス調節の全体像にかなりのターンオーバーがあるにもかかわらず、マウスのTF遺伝子同士を結び付ける全てのペア間調節相互作用のほぼ半数は、TF認識配列の進化的新機軸を介してオルソロガスなヒト細胞種で維持されていた。マウスとヒトのTF調節ネットワーク間の保存状況は、最も高次の構造レベルで特によく類似している。この研究は、マウスENCODE計画の一環として行われた。

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