計算生物学：集団の中で希少な細胞を目立たせる

混成細胞集団の中で、生理的に重要で希少な細胞タイプを見つけ出し、追跡することは、難問である。今回、H CleversとA van Oudenaardenがそれぞれ率いる2つのチームは共同研究を行い、マウスの腸管オルガノイドに単一細胞mRNA塩基配列解読法を適用することで、この問題に取り組んだ。著者たちは、単一細胞からなる複雑な集団で希少な細胞タイプを見つけ出すことができるRaceIDというアルゴリズムを開発した。この方法を用いて、腸管の希少な腸内分泌細胞のマーカーを明らかにし、さらに初代マウス腸管細胞の解析から、Lgr5を発現する集団は、パネート細胞などの少数の希少な分泌細胞を含む均一な幹細胞集団からなることを示した。

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