Volume 56 Number 1

バナナゲノムの進化

三倍体のキャベンディッシュ種バナナとグロスミチェル種バナナのゲノムアセンブリは、バナナ栽培品種の起源、病気に対する抵抗性、果実成熟のメカニズムを明らかにする。

参照論文:Li et al. Article p.136
画像提供:Aleksandr Zubkov/Moment/Getty
表紙デザイン:Tulsi Voralia
 

目次

注目のハイライト

その他のハイライト

Editorial

空間オミクスについての投稿を募集

A call for spatial omics submissions p.1

doi: 10.1038/s41588-023-01621-6

News & Views

集団遺伝学:染色体断片の共有によって古代ヒト社会をつなげる

Shared chromosomal segments connect ancient human societies p.10

doi: 10.1038/s41588-023-01606-5

変異誘発:CX-5461が二次的に誘導する大規模な変異

Extraordinary collateral mutagenesis induced by CX-5461 p.12

doi: 10.1038/s41588-023-01611-8

空間生物学:多細胞の組織構造を細胞ごとに示す

Charting multicellular tissue structure cell-to-cell p.14

doi: 10.1038/s41588-023-01624-3

機能ゲノミクス:細胞に対する刺激とレーザー光によって血液細胞の潜在的な遺伝学的形質が明らかになる

Cell perturbation and lasers illuminate the genetics of latent blood cell traits p.16

doi: 10.1038/s41588-023-01623-4

クロマチン生物学:RNAポリメラーゼIIのプロモーター近位での停止によりBAFのクロマチンへの結合とリモデリングが促進される

RNA polymerase II promoter-proximal pausing promotes BAF chromatin binding and remodeling p.19

doi: 10.1038/s41588-023-01628-z

Research Briefing

lncRNA–クロマチン回路はIL-1βによる炎症を調節する

A lncRNA–chromatin circuit regulates IL-1β-driven inflammation p.21

doi: 10.1038/s41588-023-01605-6

Brief Communication

化学療法:化学療法で用いられる薬剤CX-5461はヒト培養細胞に対して強力な変異誘発物質として作用する

The chemotherapeutic drug CX-5461 is a potent mutagen in cultured human cells p.23

doi: 10.1038/s41588-023-01602-9

Articles

パーキンソン病:パーキンソン病の複数祖先系集団ゲノムワイド関連解析のメタ解析

Multi-ancestry genome-wide association meta-analysis of Parkinson’s disease p.27

doi: 10.1038/s41588-023-01584-8

末梢血の機能ゲノミクス:ヒト血液細胞の物理的・化学的・薬理学的刺激後の表現型解析から、遺伝的に決定される潜在的形質と、これらの形質と一般的疾患のサブセットとの関連が明らかになる

Perturbational phenotyping of human blood cells reveals genetically determined latent traits associated with subsets of common diseases p.37

doi: 10.1038/s41588-023-01600-x

創薬:1万9365の遺伝子と399の薬剤適応症に対する、ヒト遺伝学に基づく優先順位スコアの開発

Development of a human genetics-guided priority score for 19,365 genes and 399 drug indications p.51

doi: 10.1038/s41588-023-01609-2

肺がん:肺腫瘍進化とがん標的治療抵抗性におけるAPOBEC3Bの役割

The role of APOBEC3B in lung tumor evolution and targeted cancer therapy resistance p.60

doi: 10.1038/s41588-023-01592-8

空間生物学:CellCharterは組織リモデリングと細胞可塑性に関連する空間的細胞ニッチを明らかにする

CellCharter reveals spatial cell niches associated with tissue remodeling and cell plasticity p.74

doi: 10.1038/s41588-023-01588-4

炎症:クロマチンによって調節される二相性回路はIL-1βが仲介する炎症を調整する

A chromatin-regulated biphasic circuit coordinates IL-1β-mediated inflammation p.85

doi: 10.1038/s41588-023-01598-2

クロマチン制御:BAFクロマチンリモデリング因子は、RNAポリメラーゼIIや転写因子と相乗的に作用してヌクレオソームを除去する

The BAF chromatin remodeler synergizes with RNA polymerase II and transcription factors to evict nucleosomes p.100

doi: 10.1038/s41588-023-01603-8

ブタ:ブタの各組織における遺伝子発現調節がもたらす影響の概要

A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues p.112

doi: 10.1038/s41588-023-01585-7

長鎖ノンコーディングRNA:計算的予測と実験的検証によって、ゼブラフィッシュからヒトまで機能的に保存されたlncRNAを特定する

Computational prediction and experimental validation identify functionally conserved lncRNAs from zebrafish to human p.124

doi: 10.1038/s41588-023-01620-7

バナナ:三倍体栽培バナナゲノムの起源と進化

Origin and evolution of the triploid cultivated banana genome p.136

doi: 10.1038/s41588-023-01589-3

古代ゲノム:古代人DNAから同祖遺伝子由来の遺伝子断片を高精度で検出する

Accurate detection of identity-by-descent segments in human ancient DNA p.143

doi: 10.1038/s41588-023-01582-w

複合ヘテロ接合:大規模なエキソーム塩基配列決定データから複合ヘテロ接合を推測する

Inferring compound heterozygosity from large-scale exome sequencing data p.152

doi: 10.1038/s41588-023-01608-3

ファインマッピング:微小な効果をモデル化することでファインマッピングを改善する

Improving fine-mapping by modeling infinitesimal effects p.162

doi: 10.1038/s41588-023-01597-3

Technical Reports

ファインマッピング:MESuSiEはゲノムワイド関連解析の原因バリアントについてのスケーラブルで強力な複数祖先系ファインマッピングを可能にする

MESuSiE enables scalable and powerful multi-ancestry fine-mapping of causal variants in genome-wide association studies p.170

doi: 10.1038/s41588-023-01604-7

多遺伝子リスクスコア:BridgePRSは祖先系集団間で共有される遺伝的効果を利用して多遺伝子リスクスコアの移植性を高める

BridgePRS leverages shared genetic effects across ancestries to increase polygenic risk score portability p.180

doi: 10.1038/s41588-023-01583-9

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